How did clary know alec was gay?

在《暮光之城》系列小说中，并没有Clary和Alec的爱情故事。Clary和Alec是《启示录三部曲》（也称为“轻薄的伪装”系列）的主角，由詹姆斯·帕特森著。在这部作品中，Clary无法知道Alec是同性恋，因为这部小说并没有提及Alec的性取向。

如果你是在问《启示录三部曲》中Clary和Alec之间如何意识到对方的感情，那么答案是通过他们之间的互动和情感交流。随着故事的发展，他们逐渐意识到彼此之间深厚的情感，并且通过对话和行为表达了自己的心意。

如果你指的是另一部作品或系列中的Clary和Alec，请提供更多的背景信息，以便我能更准确地回答你的问题。